该计划由工业、农业2个部分构成，其宗旨是以实现《云南省“十一五”科学和技术发展规划》确定的任务为目标，重点围绕“五大创新行动”和“十大科技专项”确定的有关工作内容，通过以企业为主体，产学研结合的形式，实施解决产业重大关键技术攻关、促进科技成果转化和产业化、能产生重大经济和社会效益的示范项目，为云南支柱产业、重点产业和高新技术产业发展提供科技支撑。应用基础研究重点项目、国际科技合作专项和省院省校科技合作专项是科技创新强省计划中的3个专项。